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1、过滤效果：医用防护口罩（如N95口罩）通常具有更高的过滤效率，能阻挡95%以上的细菌、病毒和其他颗粒物，而医用外科口罩主要能阻挡大部分飞溅物，但对颗粒物如飞沫的过滤效果略差。
2、使用场景：医用防护口罩主要用于接触空气传播疾病患者时保护自身安全，如疫情期间的医护人员，医用外科口罩则主要用于有创操作或接触污染物质时使用，其阻隔飞沫和血液飞溅的效果较好。
3、结构：医用防护口罩通常由三层结构组成，外层防飞沫，中间层是静电滤层，内层为亲肤材质，医用外科口罩则主要由三层无纺布组成，包括外层防水层、中间层过滤吸附层以及内层亲肤层，医用防护口罩的密封性较强，对佩戴者的呼吸有一定影响，而医用外科口罩的透气性相对较好。
医用防护外科口罩和防护口罩在过滤效果、使用场景和结构等方面都有所不同，选择哪种口罩需要根据具体的使用场景和个人需求来决定，无论使用哪种口罩，都需要正确佩戴和定期更换以保证其防护效果。